资源勘探子系统主要负责对自然资源进行调查和勘探，包括地质勘探、地球物理勘探、地球化学勘探等。通过采集和分析大量的地质、地球物理和地球化学数据，为资源开发提供科学依据和技术支持。

资源评估子系统主要用于评估自然资源的储量和品质，为资源的合理利用和开发提供参考。该子系统采用各种评估方法和技术，包括地质统计学、资源度量学、经济评估等，通过对资源进行科学评估，提供决策依据和风险控制。

资源保护子系统主要负责制定和执行资源保护和管理政策。该子系统通过建立资源保护区、开展环境监测、制定资源管理规划等措施，保护自然资源的生态功能和生态环境，实现资源的可持续利用和保护。